Το Χριστιανικό Κέντρο Λευκωσίας ξεκίνησε το 1999 όταν ο ποιμένας Σταύρος Ιγνατίου επισκέφθηκε την Κύπρο κατόπιν παρακίνησης από το Άγιο Πνεύμα.  Σ’ αυτό το ταξίδι ήρθε σε επαφή με μιαν ομάδα που αποτελείτο από 12 άτομα και η οποία προσευχόταν από το 1997 έχοντας σαν αίτημα και επιθυμία της να ξεκινήσει κάτι καινούργιο και πρωτοποριακό στην Κύπρο.

Σε πρώτο στάδιο ο ποιμένας άρχισε να διδάσκει τις αρχές του Ευαγγελίου μέσα από το Λόγο του Θεού. Σύντομα, άρχισε να λειτουργεί κάθε Τρίτη συνάθροιση προσευχής καθώς και παιδικές υπηρεσίες κάθε Σάββατο. Επίσης κάθε μήνα για μια βδομάδα γίνονταν σταθερά μαθήματα από τον ποιμένα Ιγνατίου τα οποία τελείωναν με συνάθροιση την Κυριακή το βράδυ.

Καθώς το έργο μεγάλωνε, οι μηνιαίες Κυριακάτικες συναθροίσεις έγιναν εβδομαδιαίες και ο μικρός χώρος στον οποίο στεγαζόταν η εκκλησία στον Στρόβολο δεν ήταν επαρκής για να εξυπηρετήσει τις αυξανόμενες ανάγκες. Γι’ αυτό τον Νοέμβριο του 2003, η εκκλησία μετακόμισε στην περιοχή της Έγκωμης σε ένα αρκετό μεγάλο χώρο στον οποίο και συνεχίζει να στεγάζεται μέχρι σήμερα. Αξίζει να αναφερθεί ότι ο χώρος αυτός ήταν βιοτεχνία, γι’ αυτό και ήταν απαραίτητο να γίνουν οι απαραίτητες αλλαγές ώστε να καταστεί κατάλληλος για εκκλησία. Οι εργασίες ανακαίνισης του χώρου διάρκεσαν πάνω από 6 μήνες. Αρκετά άτομα εργάστηκαν σκληρά (κάποιοι επί καθημερινής βάσης όταν σχόλαγαν από την εργασία τους) με αποτέλεσμα η πρώην βιοτεχνία να καταστεί στο τέλος ένα πραγματικό στολίδι.

Σήμερα η εκκλησία αριθμεί περί τα 170-200 άτομα. Εκτός του ότι είναι ένα υποστηρικτικό έργο για το Χριστιανικό Κέντρο Αθηνών, έχει επίσης επεκταθεί και σε διάφορες άλλες διακονίες ώστε να είναι σε θέση να καλύπτει τις ανάγκες που υπάρχουν αλλά και που συνεχώς μεταβάλλονται. Η διακονία της εκκλησίας όπως έχει πλέον εξελικτεί είναι σε θέση να καλύψει τις ανάγκες κάθε ηλικίας ανεξαρτήτου φύλου, χρώματος ή φυλής.

Ακόμα, η εκκλησία έχει καταστεί κέντρο διανομής έντυπου υλικού σε βιβλία και περιοδικά που η ίδια εκδίδει και διανέμονται σε Ελλάδα και Κύπρο. Πρόσθετα, άτομα από την εκκλησία λαμβάνουν μέρος σε ιεραποστολικά ταξίδια που διοργανώνει ο ποιμένας σε χώρες τις Μέσης Ανατολής και των Βαλκανίων. Άλλες δραστηριότητες συμπεριλαμβάνουν κατασκηνώσεις νέων, πρόγευμα αντρών, τσάι γυναικών, επισκέψεις στις φυλακές κ.λπ.

Παράλληλα, η εκκλησία έχει αναπτύξει πρόγραμμα παροχής τροφίμων και ρουχισμού για φτωχούς που είναι στη χώρα μας σαν μετανάστες, φοιτητές ή πρόσφυγες. Σαν αποτέλεσμα αυτού έχει μεταμορφωθεί (σύμφωνα μάλιστα και με την όραση που της δόθηκε από τον Θεό) σε εκκλησία με πολυεθνικό χαρακτήρα όπου Κύπριοι και άτομα από διάφορα έθνη και κουλτούρες λατρεύουν όλοι μαζί τον Θεό σε ενότητα. Γι’ αυτό το λόγο έχει επίσης αναπτυχθεί τελευταίου τύπου σύστημα ΜΕΤΑΦΡΑΣΗΣ για να εξυπηρετεί αγγλόφωνα άτομα.

Επιπλέον, έχουν τοποθετηθεί πρόσφατα 3 μεγάλες τηλεοράσεις (TV screen) στην κύρια αίθουσα για καλύτερες παρουσιάσεις.